负责种植业设施管理、节水农业、抗灾救灾、植物检疫、农作物重大病虫害防治、农膜管理有关工作。依法负责肥料，农药监督管理工作。负责粮经蔬菜产品生产环节质量安全的管理工作。负责重大植物疫情应急管理工作。

    负责畜牧、饲料、畜禽定点屠宰的管理工作。指导畜禽粪污资源化利用。负责畜禽养殖及屠宰、水产养殖环节质量安全的管理工作。负责水生野生动物的保护管理和开发利用。负责渔业安全生产管理。指导渔政执法监督工作。

    负责兽医医政、兽药药政管理工作。负责重大动物疫情应急管理工作。组织动物疫病风险评估、动物及动物产品无害化处理工作。指导动物标识及动物产品可追溯管理工作。指导动物及动物产品检疫和动物卫生执法监督工作。

    监督指导农作物、畜禽、水产种业管理工作。承担农作物、畜禽和水产种业南繁等繁育基地管理工作。负责农业植物新品种保护工作。组织抗灾救灾和救灾备荒种子的储备，调拨。负责农作物种质资源和水产、畜禽遗传资源保护和管理。指导农业生物种资源保护工作。

    指导农业机械化技术推广应用、农机安全监理工作。组织对在用的特定种类农业机械产品进行调查。指导农机作业安全。负责秸秆综合利用相关工作。

    指导农业技术推广服务体系建设。组织开展农业技术推广奖评审相关工作。

    组织实施农产品质量安全监督管理工作，制定农产品质量安全监测计划并组织实施。指导农产品质量安全监管体系、检验检测体系和信用体系建设，负责农产品检测机构考核及相关管理工作，组织开展农产品质量安全追溯工作。收集发布农产品质量安全信息。指导农产品质量安全认证工作。协助开展重大活动的农产品质量安全保障工作。负责科技项目管理工作，筛选确定与监督实施。负责农业转基因生物安全的管理工作。承担外来物种管理、科技成果管理工作。

    承担北京市通州区重大动植物疫情应急指挥部办公室的日常工作，负责信息管理、应急值守、新闻发布、应急指挥系统建设与管理工作。