负责拟定农产品质量安全发展规划并组织实施；负责《食品安全法》、《农产品质量安全法》及有关法律法规的贯彻和实施，抓好农产品质量监督管理和综合协调工作；负责无公害农产品、绿色食品、有机农产品行业管理、监督检查等工作；负责认证农产品标识管理，农产品质量追溯系统的建设；监督实施农产品技术规范和标准；组织实施农产品质量安全监督、指导和管理工作；统筹拟定农产品质量安全监测计划并监督实施；监督管理行政区域内动物防疫、种子、农药、化肥、植物病虫害检疫工作；收集发布农产品质量安全信息，指导有关农产品市场信息服务工作；组织无公害农产品产地认定；指导农业检验检测体系建设，负责农产品检测机构考核及相关管理工作；提出农业各产业标准化工作规划、计划，并对标准实施情况进行监督检查；组织拟定保障农产品质量安全的生产技术要求和操作规程；参与重大活动的农产品供应保障工作；负责农产品生产环节的监管;指导农机安全监理等工作；负责违反《动物防疫法》、《渔业法》《农业法》、《农机法》等法律、法规案件查处工作；负责畜牧水产、种植业、农业机械管理和农机安全监理等行政许可工作；负责本系统全程代办工作。